MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 7715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015564	TG	3	6	3167334	3167339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015564	CTC	2	6	3169463	3169468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_015564	CGG	2	6	3170617	3170622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_015564	CT	3	6	3170837	3170842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_015564	GTT	2	6	3170869	3170874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_015564	CTG	2	6	3170881	3170886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015564	T	6	6	3170960	3170965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015564	CTC	2	6	3173721	3173726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_015564	ATGG	2	8	3174112	3174119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015564	TCTGG	2	10	3176582	3176591	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5011	NC_015564	GGT	2	6	3176692	3176697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_015564	ACC	2	6	3178105	3178110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_015564	CAG	2	6	3178130	3178135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_015564	TGC	2	6	3178173	3178178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_015564	GGT	2	6	3178240	3178245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_015564	CCA	2	6	3184364	3184369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_015564	GCG	2	6	3184399	3184404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_015564	CGCTG	2	10	3184462	3184471	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5019	NC_015564	TCC	2	6	3185806	3185811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_015564	TCT	2	6	3185831	3185836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_015564	GAGGGA	2	12	3186611	3186622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_015564	TGC	2	6	3186623	3186628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_015564	CGAA	2	8	3186691	3186698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_015564	CGT	2	6	3188664	3188669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_015564	GT	3	6	3188668	3188673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_015564	ACC	2	6	3188692	3188697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_015564	CATGG	2	10	3188783	3188792	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5028	NC_015564	GTC	2	6	3188843	3188848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_015564	CTG	2	6	3189734	3189739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_015564	CAC	2	6	3189763	3189768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_015564	CGT	2	6	3189775	3189780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_015564	ACG	2	6	3189843	3189848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_015564	CGT	2	6	3191461	3191466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_015564	GTA	2	6	3193350	3193355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_015564	GCC	2	6	3194896	3194901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_015564	CCCGG	2	10	3198589	3198598	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5037	NC_015564	CCCCT	2	10	3198664	3198673	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5038	NC_015564	TGG	2	6	3202065	3202070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015564	GC	3	6	3202087	3202092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_015564	GAGGCT	2	12	3204353	3204364	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5041	NC_015564	GGGT	2	8	3204371	3204378	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_015564	TCC	2	6	3204383	3204388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_015564	GC	3	6	3208530	3208535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_015564	TCC	2	6	3208548	3208553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_015564	GA	3	6	3208582	3208587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015564	CGG	2	6	3208590	3208595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_015564	CGA	2	6	3208596	3208601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_015564	CAC	3	9	3208642	3208650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_015564	GCA	2	6	3208665	3208670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_015564	GA	3	6	3208689	3208694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015564	TGA	2	6	3208732	3208737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015564	CTG	2	6	3208786	3208791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_015564	CCACA	2	10	3209456	3209465	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5054	NC_015564	GGT	2	6	3209528	3209533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_015564	CA	3	6	3210278	3210283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_015564	CCG	2	6	3211546	3211551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_015564	ACCG	2	8	3211637	3211644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_015564	GCA	2	6	3211698	3211703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_015564	CAA	2	6	3211713	3211718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_015564	CCACAA	2	12	3212155	3212166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_015564	TCG	2	6	3212199	3212204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_015564	TG	3	6	3214187	3214192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015564	TG	3	6	3214200	3214205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015564	ATC	2	6	3214965	3214970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_015564	AGGGC	2	10	3214974	3214983	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5066	NC_015564	CGC	2	6	3214984	3214989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_015564	TCG	2	6	3220517	3220522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_015564	GCTG	2	8	3220540	3220547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_015564	GCCCC	2	10	3220562	3220571	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5070	NC_015564	CCGCG	2	10	3220578	3220587	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5071	NC_015564	TCCG	2	8	3220642	3220649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_015564	CCGA	2	8	3220686	3220693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_015564	TAA	2	6	3221203	3221208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015564	TCC	2	6	3222704	3222709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_015564	GCG	2	6	3222774	3222779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_015564	ACG	2	6	3222818	3222823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_015564	TCA	2	6	3223126	3223131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_015564	AGC	2	6	3223143	3223148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_015564	CGA	2	6	3224211	3224216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_015564	ACC	2	6	3224229	3224234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_015564	CGA	2	6	3224249	3224254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_015564	CAC	2	6	3224261	3224266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_015564	TCT	2	6	3224359	3224364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_015564	TCG	2	6	3224407	3224412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_015564	TGG	2	6	3224485	3224490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_015564	AG	3	6	3224782	3224787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_015564	CGC	2	6	3224810	3224815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_015564	CGGGG	2	10	3224838	3224847	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5089	NC_015564	ACG	2	6	3225541	3225546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_015564	AGA	2	6	3225565	3225570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_015564	AGC	2	6	3226390	3226395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_015564	GCG	2	6	3228206	3228211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_015564	ATCG	2	8	3228275	3228282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_015564	GTG	2	6	3228310	3228315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015564	GC	3	6	3228889	3228894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_015564	TGC	2	6	3228938	3228943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_015564	TGC	2	6	3229013	3229018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_015564	GT	3	6	3229862	3229867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015564	CGC	2	6	3229868	3229873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_015564	GC	3	6	3229872	3229877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_015564	CAC	2	6	3234528	3234533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_015564	CTG	2	6	3238534	3238539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_015564	GAC	2	6	3238560	3238565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_015564	TG	3	6	3238654	3238659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015564	CAC	2	6	3238689	3238694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_015564	GAG	2	6	3238699	3238704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_015564	CGA	2	6	3238707	3238712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_015564	CTC	2	6	3239741	3239746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_015564	TAC	2	6	3239772	3239777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_015564	CGG	2	6	3240828	3240833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_015564	CG	3	6	3240862	3240867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_015564	CTG	2	6	3242172	3242177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_015564	ACT	2	6	3242192	3242197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_015564	CA	3	6	3242283	3242288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_015564	CCT	2	6	3242346	3242351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_015564	AGC	2	6	3242372	3242377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_015564	CGC	2	6	3243738	3243743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_015564	CAC	2	6	3243767	3243772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_015564	AAC	2	6	3245294	3245299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_015564	CCT	2	6	3249017	3249022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_015564	CG	3	6	3249050	3249055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_015564	TGCGA	2	10	3250460	3250469	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5123	NC_015564	CGG	2	6	3250551	3250556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_015564	TGA	2	6	3251622	3251627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_015564	TGCG	2	8	3253338	3253345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_015564	GTT	2	6	3254408	3254413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015564	CCGC	2	8	3254444	3254451	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5128	NC_015564	TGC	2	6	3254476	3254481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_015564	GGT	2	6	3254496	3254501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_015564	GTG	2	6	3258469	3258474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_015564	GC	3	6	3258529	3258534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_015564	GCTC	2	8	3258549	3258556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5133	NC_015564	TGGCC	2	10	3258557	3258566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5134	NC_015564	CGA	2	6	3258580	3258585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5136	NC_015564	CCGG	2	8	3259290	3259297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5137	NC_015564	TCG	2	6	3259311	3259316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5142	NC_015564	CGA	2	6	3259512	3259517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5149	NC_015564	GC	3	6	3262802	3262807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5150	NC_015564	CTG	3	9	3262828	3262836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5152	NC_015564	CCAT	2	8	3265347	3265354	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5164	NC_015564	CGG	2	6	3273981	3273986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5258	NC_015564	ACCC	2	8	3327638	3327645	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5259	NC_015564	CA	3	6	3327655	3327660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5261	NC_015564	GCT	2	6	3327786	3327791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_015564	CCT	2	6	3327802	3327807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_015564	ACG	2	6	3328138	3328143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5265	NC_015564	CACCC	2	10	3328310	3328319	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5266	NC_015564	GAAGG	2	10	3328321	3328330	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_015564	CTCCC	2	10	3328372	3328381	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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5273	NC_015564	CGG	2	6	3328610	3328615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5281	NC_015564	A	6	6	3328962	3328967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5283	NC_015564	ACA	2	6	3329015	3329020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5284	NC_015564	CA	4	8	3329019	3329026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5285	NC_015564	CCAG	2	8	3329044	3329051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5291	NC_015564	TGA	2	6	3329174	3329179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5293	NC_015564	GCC	2	6	3329232	3329237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5296	NC_015564	TGACG	2	10	3329403	3329412	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5298	NC_015564	TG	3	6	3329586	3329591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5375	NC_015564	CGCA	2	8	3360133	3360140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5376	NC_015564	ATG	2	6	3360161	3360166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5378	NC_015564	TCGC	2	8	3360226	3360233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5383	NC_015564	GCC	2	6	3361143	3361148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5386	NC_015564	CGC	2	6	3361577	3361582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5387	NC_015564	CA	3	6	3361589	3361594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5388	NC_015564	GAC	2	6	3361602	3361607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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